恐怖组织“瓦干布”渗透香港，在香港掀起一场化武争夺战，飞虎队总指挥范少锋（陈豪(陈豪 饰) 饰）临危受命，率飞虎队与恐怖分子斗智斗勇。飞虎队身陷瓦干布的无情杀局，特勤队警司展博文（马德钟(马德钟 饰) 饰）召集警界精英张伟桦（张兆辉(张兆辉 饰) 饰）、张嘉轩（黄宗泽(黄宗泽 饰) 饰）和高子乐（吴卓羲(吴卓羲 饰) 饰）成立秘密反恐小组S Team。面对重重危机，在国际刑警许俊飞（苗侨伟(苗侨伟 饰) 饰）的协助下，中青两代最终放下恩怨情仇，联手阻止化武病毒在香港蔓延。