1991年，27岁的埃克斯顿主演了影片《英伦小霸王》，直到两年后凭借电视剧《Cracker》才开始真正受到关注，同时又主演了丹尼·博伊尔的低成本处女作《同屋三分惊》，年轻的伊万·麦克格雷格也在这部片中展露头脚。之后埃克莱斯顿成功出演了BBC连续剧《Our Friends in the North》，名字开始在英国家喻户晓，剧中为他配戏的则是另一位日后大红大紫的演员丹尼尔·克雷格。电影方面他同迈克尔·温特伯顿先后合作《无名的裘德》和《24小时派对狂》，与大卫·柯南伯格、裘德·洛合作《感官游戏》，与凯特·布兰切特合作《伊丽莎白女王》，还与好莱坞著名女影星安吉丽娜·朱莉、妮可·基德曼、蕾妮·齐薇格以及卡梅隆·迪亚兹分别合作过影片《急速六十秒》、《小岛惊魂》、《自由的代价》和《不可见的把戏》 ，2002年再次携手丹尼·博伊尔，出演了《惊变28天》。电视方面他凭借《Our Friends in the North》和04年《The Second Coming》两度被提名英国电视最高奖项男主角奖，可惜分别输给老将奈杰尔·霍桑和比尔·奈利。2004年在Radio Times一次关于电视领域最具影响人物的排名当中，克里斯托弗·埃克莱斯顿被票选为19位。

2005年3月开始播出的新版科幻剧《神秘博士》中，埃克斯顿成为了第九任博士扮演者，这是件非常荣耀的事情，可惜他却因与剧组不和及其他一些复杂原因而在短短一季后离开，继任者是合作过《无名的裘德》的大卫·田纳特。之后他重新回到戏剧舞台，并在06年客串热门美剧《超能英雄》，另外出演了不太成功的小说改编影片《黑暗崛起》。他的新作也将是一部好莱坞作品，《特种部队》中这位Dr.Who将如何演绎大反派Destro备受人们期待。 之后于2013年漫威电影《雷神2：黑暗世界》中出演反派BOSS。

2005年4月他被任命为英国知名慈善团体Mencap的慈善大使，并热忱支持英国红十字会；2007年9月索尔福德的彭德尔顿学院以他的名字命名了260席的新剧院“Eccleston Theatre”。

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