2013年，与克里斯·巴克联合执导个人首部动画电影《冰雪奇缘》，该片改编自安徒生童话《白雪皇后》，讲述小国阿伦黛尔因一个魔咒永远地被冰天雪地覆盖，为了寻回夏天，安娜公主和山民克里斯托夫以及他的驯鹿搭档组队出发，展开一段拯救王国的历险 ，获得第67届英国电影和电视艺术学院奖电影奖-最佳动画片奖、第86届奥斯卡奖-最佳动画长片奖 ，她凭借该片获得第41届安妮奖-最佳动画电影导演奖 。

2015年，执导动画短片《冰雪奇缘：生日惊喜》 。2016年，担任动画电影《疯狂动物城》的编剧 。2017年，执导动画短片《雪宝的冰雪大冒险》。2018年，担任科幻冒险电影《时间的皱折》的编剧，该片由阿娃·杜威内执导 。2019年11月22日，与克里斯·巴克联合执导的冒险动画电影《冰雪奇缘2》在北美和中国内地同步上映 。

在动画电影《冰雪奇缘》中，珍妮弗·李与克里斯·巴克纯熟地使用象征性手法，成功地构建了一个神奇的魔法世界，塑造了一系列生动、丰满的人物形象，完整讲述了一个主题鲜明、令人感动的故事。《冰雪奇缘》的成功也再次印证了象征手法的运用和象征意义的赋予对于童话题材的动画电影的重要性，值得动画电影创作者学习和借鉴 。而且，不仅承袭了迪士尼动画的一贯风格，不落俗套地蕴涵着深刻的生活哲理，而且把铺垫和转折、伏笔和照应、穿插与渲染等叙事艺术手法运用得精致巧妙，为人物矛盾、命运转折做了恰切的诠释和衬托 （《大舞台》、《大众文艺》综合评）。