《神医传奇》半夏(郭珍霓 饰)结局是死了。伤心欲绝的半夏气势汹汹地去找独活复仇。可是，两人的武功旗鼓相当。数番搏斗下去，仍分不出上下。独活想要求半夏放了自己，可是被憎恨遮盖眼睛的半夏哪儿肯，她不惜代价要杀掉独活为姬重报仇雪恨。最后，两人也只能是鱼死网破。

战国，一次意外让赵国郡主半夏沦落弃儿。她沦落民间，认识医仙苍术(张卫健 饰)的两个弟子狗宝(高昊 饰)和独活，及其巫医葛根(吴孟达 饰)的闺女丁香。四人两小无猜，一起成长。半夏的爱人独活行医技术精湛，但贪念锦华，忘恩负义。半夏慢慢察觉狗宝就是她一生中最爱。狗宝出生低贱，擅出奇招看病，一辈子梦想只在济世救人。可命数一次次把他拖进困境中。

狗宝恪守公平正义，坚守医道，在丁香、葛根、半夏及其几个弟子的帮忙下，潜心研究学习进修医术，用神奇的行医技术数次挫败独活的阴谋诡计。独活坏事做多了，最后只能自取灭亡。狗宝最后也完成人生目标，离开恩仇是是非非，带上爱人丁香环游民间，终身为老百姓看病，救护老百姓不计其数，被后人老百姓尊为医仙。